Trois équipes, avec un total d’une cinquantaine de personnes, travaillent au Centre de Contrôle de l'ATV (ATV-CC), au centre spatial du CNES à Toulouse, dans 3 salles séparées par des baies vitrées :

- Au centre de la photo, l'Equipe de Contrôle de Vol, responsable des opérations de l'ATV pendant la première simulation conjointe qui a été réalisée le 31 juillet 2007. La salle de contrôle principale est consacrée à l’exécution de la mission de l’ATV confiée l'équipe de contrôle de vol du CNES, dirigée par le directeur de vol.

- L'équipe ESA de gestion des Opérations de l’ATV (Operations Management Team, OMT), responsable de la préparation globale des opérations et de leur exécution, et de la prise de décision pour des situations d’anomalie et d’urgence.

- L'équipe d’experts (Engineering Support Team), qui fournit l'analyse de vol et l'expertise pour la mission entière.